<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">I also did the calculation with output_format = 5 and the problem continues. <br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Regards, Alvaro<br><br>--- Em <b>sex, 13/3/09, Álvaro Alves <i>&lt;asafis@yahoo.com.br&gt;</i></b> escreveu:<br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;">De: Álvaro Alves &lt;asafis@yahoo.com.br&gt;<br>Assunto: [xcrysden] pp<br>Para: xcrysden@democritos.it<br>Data: Sexta-feira, 13 de Março de 2009, 15:12<br><br><div id="yiv923298851"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top"><br>Hello users, I am trying to use the
 Xcrysden, but I am not getting success. I
did a SCF calculation and can see the ouput well . However, the output
of post-processing calculation is with problem. Appears disconnected
atoms. Below, it is the input that you use to pp.<br><br>&amp;inputpp<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; prefix&nbsp; = 'sad1'<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; outdir = '/home/sgi/proj/proj394/asa/trabalhos/moleculas/sad1/Cu_F-ON/scf-mp/'<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; filplot = 'sad1_polarization'<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; plot_num= 6<br>&nbsp;/<br>&nbsp;&amp;plot<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; nfile = 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; iflag = 3<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; output_format = 6<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; fileout = 'sad1.polarization.xsf'<br>&nbsp;/<br><br>I think so may be a problem in pp, since the SCF calculation is correct.<br><br>&nbsp; Regards, Alvaro<br><br></td></tr></tbody></table><br>


      <hr size="1">Veja quais são os assuntos do momento no Yahoo! + Buscados: <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/">Top 10</a> - <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/celebridades/">Celebridades</a> - <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/m%C3%BAsica/">Música</a> - <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/esportes/">Esportes</a></div><pre>_______________________________________________<br>XCrySDen mailing list<br>XCrySDen@democritos.it<br>http://www.democritos.it/mailman/listinfo/xcrysden<br></pre></blockquote></td></tr></table><br>


      <hr size=1>Veja quais são os assuntos do momento no Yahoo! + Buscados: <a href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/">Top 10</a> - <a href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/celebridades/">Celebridades</a> - <a href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/m%C3%BAsica/">Música</a> - <a href="http://br.rd.yahoo.com/mail/taglines/mail/*http://br.maisbuscados.yahoo.com/esportes/">Esportes</a>