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<TITLE>Re: [Pw_forum] nsfd</TITLE>
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<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>Hi Axel,<BR>
<BR>
Thank you! &nbsp;<BR>
Honestly, I am ignorant in this area, and I am trying to pick up little by little. &nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
<BR>
Trinh<BR>
<BR>
P.S. &nbsp;I am sorry, I don&#8217;t know why I was haunted by the word &#8220;NSF&#8221;. &nbsp;:-). &nbsp;&nbsp;Paolo pointed out, but I kept repeating it. &nbsp;&nbsp;<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
On 7/17/09 7:49 PM, &quot;Axel Kohlmeyer&quot; &lt;<a href="akohlmey@cmm.chem.upenn.edu">akohlmey@cmm.chem.upenn.edu</a>&gt; wrote:<BR>
<BR>
</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>On Fri, 2009-07-17 at 19:00 -0700, Vo, Trinh (388C) wrote:<BR>
&gt; Hi Paolo,<BR>
&gt;<BR>
&gt; Thank you for your message. <BR>
&gt;<BR>
&gt; I understand now (hope it is correct). &nbsp;&nbsp;Since we do not have Parallel<BR>
&gt; File system on our cluster, all I/O via the network are used. &nbsp;One<BR>
&gt; option now is probably to write directly on local scratch disk to<BR>
&gt; avoid NSF. &nbsp;(I do not like this option very much). &nbsp;In your opinion,<BR>
&gt; is it possible to add the Parallel File System to an existing cluster?<BR>
<BR>
yes. but it is an administrative nightmare. if you still<BR>
confuse NFS with NSF, then you should not get into it.<BR>
regardless, using a local scratch is _much_ better and<BR>
needs to additional configuration.<BR>
<BR>
cheers,<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;axel.<BR>
<BR>
&gt; &nbsp;<BR>
&gt;<BR>
&gt; Trinh &nbsp;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; On 7/17/09 2:32 AM, &quot;Paolo Giannozzi&quot; &lt;<a href="giannozz@democritos.it">giannozz@democritos.it</a>&gt; wrote:<BR>
&gt;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;On Jul 17, 2009, at 2:47 , Vo, Trinh (388C) wrote:<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I usually saw lines of &#8216;nsfd&#8217; appear on the &#8216;Command&#8217;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;column. &nbsp;What<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; &#8216;nsfd&#8217; means?<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&quot;National Science Foundation daemon&quot;. It checks how you are<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;spending the<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;taxpayer's money, terminates your NSF grant if you are wasting<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;it :-)<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Seriously: it is &quot;nfsd&quot;, it stands for &quot;network file system<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;daemon&quot;,<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;it means that<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;you are performing heavy I/O via the network, using the nfs<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;software.<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;This is something you should avoid as much as possible.<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Paolo<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;---<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Paolo Giannozzi, Dept of Physics, University of Udine<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;_______________________________________________<BR>
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&nbsp;&nbsp;&nbsp;Center for Molecular Modeling &nbsp;&nbsp;-- &nbsp;&nbsp;University of Pennsylvania<BR>
Department of Chemistry, 231 S.34th Street, Philadelphia, PA 19104-6323<BR>
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