Dear Axel,<br>
<br>
Thanks for pointing this out! I am already aware of it. I thought that
we only need to specify the single unit cell parameter. For my case, I
have like 6 unit cell aligned in one direction. How can I find out the
new lattice parameter and symmetry of the nanostructure (6 unit cell)? <br>
Your suggestions are welcomed!<br>
<br>
Thanks in advance for your help!<br>
<br>
Mohamed Sabri Majdoub<br>
PhD candidate Mechanical Engineering<br>
University of Houston, TX,USA<br>
<br>----- Original Message -----<br>From: Axel Kohlmeyer &lt;akohlmey@cmm.chem.upenn.edu&gt;<br>Date: Thursday, May 8, 2008 2:34 pm<br>Subject: Re: [Pw_forum] Au relaxation error<br>To: Mohamed.Majdoub@mail.uh.edu<br>Cc: pw_forum@pwscf.org<br><br>&gt; On Thu, 8 May 2008, Mohamed.Majdoub@mail.uh.edu wrote:<br>&gt; <br>&gt; MM&gt; Dear users,<br>&gt; <br>&gt; mohamed,<br>&gt; <br>&gt; please _first_ study the online documentation, troubleshooting<br>&gt; tips and the mailing list archives. this error is one of the<br>&gt; most frequently reported ones...<br>&gt; <br>&gt; cheers,<br>&gt; &nbsp;&nbsp; axel.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; p.s.: ...and while you are at it, please consider the policy here<br>&gt; to state your name and affiliation. thanks.<br>&gt; <br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; -------------------------------------------------------------<br>&gt; ---------------&nbsp; <br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation #&nbsp; 2 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0139992 -0.0139992&nbsp; 0.0000000&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation #&nbsp; 7 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0069996 -0.0069996 -0.0069996&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation #&nbsp; 8 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0069996 -0.0069996&nbsp; 0.0069996&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation # 27 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0069996 -0.0069996 -0.0069996&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation # 28 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0069996 -0.0069996&nbsp; 0.0069996&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; warning: symmetry operation # 29 not allowed.&nbsp;&nbsp; <br>&gt; fractional translation:<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0139992 -0.0139992&nbsp; 0.0000000&nbsp; in crystal coordinates<br>&gt; MM&gt; .......<br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; &nbsp; Initial potential from superposition of free atoms<br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; starting charge&nbsp; 395.74037, renormalised to&nbsp; 396.00000<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Starting wfc are atomic<br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; <br>&gt; &nbsp;%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; from cdiaghg : error #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 325<br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; info =/= 0<br>&gt; MM&gt; <br>&gt; &nbsp;%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%MM&gt; <br>&gt; MM&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; stopping ...<br>&gt; MM&gt; -------------------------------------------------------------<br>&gt; -----------<br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; <br>&gt; MM&gt; <br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; =======================================================================<br>&gt; Axel Kohlmeyer&nbsp;&nbsp; <br>&gt; akohlmey@cmm.chem.upenn.edu&nbsp;&nbsp; http://www.cmm.upenn.edu<br>&gt; &nbsp;&nbsp; Center for Molecular Modeling&nbsp;&nbsp; --<br>&gt; &nbsp;&nbsp; University of Pennsylvania<br>&gt; Department of Chemistry, 231 S.34th Street, Philadelphia, PA <br>&gt; 19104-6323<br>&gt; tel: 1-215-898-1582,&nbsp; fax: 1-215-573-6233,&nbsp; office-<br>&gt; tel: 1-215-898-5425<br>&gt; =======================================================================<br>&gt; If you make something idiot-proof, the universe creates a better <br>&gt; idiot.