[Pw_forum] problem in parallel running
Huiqun Zhou
hqzhou at nju.edu.cn
Mon Aug 24 11:35:57 CEST 2009
Sharma,
Let me try to put it clearer. Paolo means that the compute nodes involved
in the computation must be able to "see" the folder /home/devsharma/pseudo,
meaning the pseudo folder must be located on a NFS, which is shared
by the head node, the one you submitted your job, and compute nodes,
on which your job is executed.
If your job was submitted to the head node itself, that will be very strange.
You need to let us know your cluster environment.
Huiqun Zhou
@Nanjing University, China
----- Original Message -----
From: dev sharma
To: PWSCF Forum
Sent: Monday, August 24, 2009 5:10 PM
Subject: Re: [Pw_forum] problem in parallel running
Dear Sir,
I am sending all the terminal commands to you. Please guide me.,
[devsharma at headnode ~]$ ls
espresso-4.0.2 pseudo tmp work
[devsharma at headnode ~]$ cd pseudo/
[devsharma at headnode pseudo]$ ls
0710.pdf Cr.pw91-sp-van.info Li.pz-n-vbc.UPF Pt.pw91-n-van.info
Ag.pbe-d-rrkjus.info Cr.pw91-sp-van.UPF Li.pz-s-mt.UPF Pt.pw91-n-van.UPF
Ag.pbe-d-rrkjus.UPF Cs.pbe-mt_bw.info Li.pz-s-van_ak.info Pt.pz-nd-rrkjus.UPF
Ag.pz-d-rrkjus.UPF Cs.pbe-mt_bw.UPF Li.pz-s-van_ak.UPF Pt.pz-rrkjus.UPF
Al.blyp-n-van_ak.info C.tpss-mt.UPF Mg.pw91-np-van.info Pt.rel-pz-n-rrkjus.UPF
Al.blyp-n-van_ak.UPF Cu.blyp-n-van_ak.info Mg.pw91-np-van.UPF Re.pw91-n-van.info
Al.bp-n-van_ak.info Cu.blyp-n-van_ak.UPF Mg.pz-bhs.UPF Re.pw91-n-van.UPF
Al.bp-n-van_ak.UPF Cu.pbe-d-rrkjus.info Mg.pz-n-vbc.info Rh.pbe-nd-rrkjus.UPF
Al.pbe-n-van.info Cu.pbe-d-rrkjus.UPF Mg.pz-n-vbc.UPF Rh.pbe-rrkjus.UPF
Al.pbe-n-van.UPF Cu.pbe-n-van_ak.info Mn.pbe-sp-van.info Rh.pz-rrkjus.UPF
Al.pbe-rrkj.UPF Cu.pbe-n-van_ak.UPF Mn.pbe-sp-van.UPF Ru.pbe-n-van.info
Al.pw91-n-van.info Cu.pw91-n-van_ak.info Mo.pw91-n-van.info Ru.pbe-n-van.UPF
Al.pw91-n-van.UPF Cu.pw91-n-van_ak.UPF Mo.pw91-n-van.UPF Ru.pw91-n-van.info
Al.pz-vbc.UPF Cu.pz-d-rrkjus.UPF Na.blyp-sp-van_ak.info Ru.pw91-n-van.UPF
Ar.pz-rrkj.info Cu.pz-n-van_ak.info Na.blyp-sp-van_ak.UPF S.blyp-mt.info
Ar.pz-rrkj.UPF Cu.pz-n-van_ak.UPF Na.bp-sp-van_ak.info S.blyp-mt.UPF
As.pbe-n-van.info Fe.blyp-sp-van_ak.info Na.bp-sp-van_ak.UPF S.blyp-van_ak.info
As.pbe-n-van.UPF Fe.blyp-sp-van_ak.UPF Na.pbe-n-mt_bw.info S.blyp-van_ak.UPF
As.pw91-n-van.info Fe.blyp-sp-van.info Na.pbe-n-mt_bw.UPF S.bp-van_ak.info
As.pw91-n-van.UPF Fe.blyp-sp-van.UPF Na.pbe-n-van.UPF S.bp-van_ak.UPF
As.pz-bhs.info Fe.bp-sp-van_ak.info Na.pbe-sp-van_ak.info Sb.pw91-n-van.info
As.pz-bhs.UPF Fe.bp-sp-van_ak.UPF Na.pbe-sp-van_ak.UPF Sb.pw91-n-van.UPF
Au.blyp-van_ak.info Fe.pbe-nd-rrkjus.UPF Na.pw91-n-mt.UPF Sb.pz-bhs.info
Au.blyp-van_ak.UPF Fe.pbe-sp-van_ak.info Na.pw91-n-van.UPF Sb.pz-bhs.UPF
Au.bp-van_ak.info Fe.pbe-sp-van_ak.UPF Na.pw91-sp-van_ak.info Sc.pbe-nsp-van.info
Au.bp-van_ak.UPF Fe.pbe-sp-van.info Na.pw91-sp-van_ak.UPF Sc.pbe-nsp-van.UPF
Au.pbe-nd-rrkjus.UPF Fe.pbe-sp-van_mit.info Na.pz-n-vbc.info Sc.pw91-nsp-van.info
Au.pbe-nd-van.info Fe.pbe-sp-van_mit.UPF Na.pz-n-vbc.UPF Sc.pw91-nsp-van.UPF
Au.pbe-nd-van.UPF Fe.pbe-sp-van.UPF Na.pz-sp-van_ak.info Se.pbe-van.info
Au.pbe-van_ak.info Fe.pw91-sp-van_ak.info Na.pz-sp-van_ak.UPF Se.pbe-van.UPF
Au.pbe-van_ak.UPF Fe.pw91-sp-van_ak.UPF Nb.elastic_constant_tests.pdf Se.pz-bhs.info
Au.pw91-d-van.UPF Fe.pz-nd-rrkjus.UPF N.blyp-mt.info Se.pz-bhs.UPF
Au.pw91-van_ak.info Fe.pz-sp-van_ak.info N.blyp-mt.UPF Si.pbe-n-van.info
Au.pw91-van_ak.UPF Fe.pz-sp-van_ak.UPF N.blyp-van_ak.info Si.pbe-n-van.UPF
Au.pz-d-rrkjus.UPF filename.upf N.blyp-van_ak.UPF Si.pbe-rrkj.UPF
Au.pz-d-van.UPF F.pbe-n-van.info Nb.pbe-nsp-van.info Si.pw91-n-van.info
Au.pz-van_ak.info F.pbe-n-van.UPF Nb.pbe-nsp-van.UPF Si.pw91-n-van.UPF
Au.pz-van_ak.UPF F.pw91-n-van.info N.bp-van_ak.info Si.pz-vbc.UPF
Au.rel-pz-rrkjus.UPF F.pw91-n-van.UPF N.bp-van_ak.UPF Si.tpss-mt.UPF
Ba.pbe-nsp-van.info Ga.pbe-nsp-van.info Nb.pw91-nsp-van.info Sn.pw91-n-van.info
Ba.pbe-nsp-van.UPF Ga.pbe-nsp-van.UPF Nb.pw91-nsp-van.UPF Sn.pw91-n-van.UPF
Ba.pw91-nsp-van.info Ga.pw91-nsp-van.info Nb.pz-sp-van.info Sn.pz-bhs.info
Ba.pw91-nsp-van.UPF Ga.pw91-nsp-van.UPF Nb.pz-sp-van.UPF Sn.pz-bhs.UPF
B.blyp-n-van_ak.info Ga.pz-bhs.info Ni.pbe-nd-rrkjus.UPF S.pbe-van_bm.info
B.blyp-n-van_ak.UPF Ga.pz-bhs.UPF Ni.pz-nd-rrkjus.UPF S.pbe-van_bm.UPF
B.bp-n-van_ak.info Ge.pw91-n-van.info N.pbe-rrkjus.UPF S.pw91-n-mt.info
B.bp-n-van_ak.UPF Ge.pw91-n-van.UPF N.pbe-van_ak.info S.pw91-n-mt.UPF
Be.pz-n-vbc.info Ge.pz-bhs.info N.pbe-van_ak.UPF S.pw91-van_ak.info
Be.pz-n-vbc.UPF Ge.pz-bhs.UPF N.pbe-van_bm.info S.pw91-van_ak.UPF
Be.star1s-pz-n-vbc.UPF Ge.tpss-n-mt.UPF N.pbe-van_bm.UPF S.pz-bhs.info
Bi.pbe-d-mt.info H.blyp-van_ak.info N.pw91-van_ak.info S.pz-bhs.UPF
Bi.pbe-d-mt.UPF H.blyp-van_ak.UPF N.pw91-van_ak.UPF S.pz-van_ak.info
B.pbe-n-van_ak.info H.blyp-vbc.info N.pz-rrkjus.UPF S.pz-van_ak.UPF
B.pbe-n-van_ak.UPF H.blyp-vbc.UPF N.pz-van_ak.info Sr.pbe-nsp-van.info
B.pbe-n-van.info H.bp-van_ak.info N.pz-van_ak.UPF Sr.pbe-nsp-van.UPF
B.pbe-n-van.UPF H.bp-van_ak.UPF N.pz-vbc.info Sr.pbe-sp-van.info
B.pw91-n-van_ak.info He.pbe-mt_fhi.UPF N.pz-vbc.UPF Sr.pbe-sp-van.UPF
B.pw91-n-van_ak.UPF He.pz-mt_fhi.UPF O.blyp-mt.info Sr.pw91-nsp-van.info
B.pw91-n-van.info H.pbe-rrkjus.UPF O.blyp-mt.UPF Sr.pw91-nsp-van.UPF
B.pw91-n-van.UPF H.pbe-van_ak.info O.blyp-van_ak.info Ta.pbe-nsp-van.info
B.pz-bhs.UPF H.pbe-van_ak.UPF O.blyp-van_ak.UPF Ta.pbe-nsp-van.UPF
B.pz-vbc.UPF H.pbe-van_bm.info O.bp-van_ak.info Ta.pw91-nsp-van.info
Br.pbe-van_mit.info H.pbe-van_bm.UPF O.bp-van_ak.UPF Ta.pw91-nsp-van.UPF
Br.pbe-van_mit.UPF H.pbe-vbc.UPF O.pbe-mt.UPF Te.pbe-rrkj.UPF
Br.pw91-mt.info H.pw91-van_ak.info O.pbe-rrkjus.UPF Te.pz-bhs.info
Br.pw91-mt.UPF H.pw91-van_ak.UPF O.pbe-van_ak.info Te.pz-bhs.UPF
Br.pz-vbc.UPF H.pz-rrkjus.UPF O.pbe-van_ak.UPF Ti.blyp-sp-van_ak.info
Ca.pbe-nsp-van.info H.pz-van_ak.info O.pbe-van_bm.info Ti.blyp-sp-van_ak.UPF
Ca.pbe-nsp-van.UPF H.pz-van_ak.UPF O.pbe-van_bm.UPF Ti.bp-sp-van_ak.info
Ca.pw91-nsp-van.info H.pz-vbc.UPF O.pw91-van_ak.info Ti.bp-sp-van_ak.UPF
Ca.pw91-nsp-van.UPF H.tpss-mt.UPF O.pw91-van_ak.UPF Ti.pbe-sp-van_ak.info
Ca.pz-n-vbc.UPF In.pbe-d-rrkjus.info O.pz-mt.info Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
C.blyp-mt.info In.pbe-d-rrkjus.UPF O.pz-mt.UPF Ti.pw91-nsp-van.info
C.blyp-mt.UPF In.pz-bhs.info O.pz-rrkjus.UPF Ti.pw91-nsp-van.UPF
C.blyp-van_ak.info In.pz-bhs.UPF O.pz-van_ak.info Ti.pw91-sp-van_ak.info
C.blyp-van_ak.UPF In.pz-d-rrkjus.info O.pz-van_ak.UPF Ti.pw91-sp-van_ak.UPF
C.bp-van_ak.info In.pz-d-rrkjus.UPF O.rel-pz-rrkjus.UPF Ti.pz-sp-van_ak.info
C.bp-van_ak.UPF In.pz-n-bhs.info Os.pbe-n-van.info Ti.pz-sp-van_ak.UPF
Cd.pbe-n-van.info In.pz-n-bhs.UPF Os.pbe-n-van.UPF Ti.pz-sp-van.info
Cd.pbe-n-van.UPF I.pbe-mt_bw.info Os.pw91-n-van.info Ti.pz-sp-van.UPF
Cd.pw91-n-van.info I.pbe-mt_bw.UPF Os.pw91-n-van.UPF Tl.pz-d-van.info
Cd.pw91-n-van.UPF Ir.pbe-n-rrkjus.info O.tpss-mt.UPF Tl.pz-d-van.UPF
Ce4_ps_f1d1-pbe-rc1.0.uspp.UPF Ir.pbe-n-rrkjus.UPF P.blyp-mt.info V.pbe-n-van.UPF
Cl.blyp-mt.info Ir.pbe-n-van.UPF P.blyp-mt.UPF V.pbe-sp-van.UPF
Cl.blyp-mt.UPF Ir.pw91-n-van.UPF P.blyp-van_ak.info W.pbe-nsp-van.info
Cl.pbe-n-van.info K.blyp-mt.info P.blyp-van_ak.UPF W.pbe-nsp-van.UPF
Cl.pbe-n-van.UPF K.blyp-n-mt.UPF Pb.pbe-d-van.info W.pw91-nsp-van.info
Cl.pw91-mt.info K.pz-n-vbc.info Pb.pbe-d-van.UPF W.pw91-nsp-van.UPF
Cl.pw91-mt.UPF K.pz-n-vbc.UPF P.bp-van_ak.info W.pz-bhs.UPF
Cl.pz-bhs.info K.pz-sp-van.info P.bp-van_ak.UPF Xe.pw91-n-van.info
Cl.pz-bhs.UPF K.pz-sp-van.UPF Pb.pz-bhs.UPF Xe.pw91-n-van.UPF
Co.pbe-nd-rrkjus.UPF Kr.pw91-n-van.info Pb.pz-d-van.info Y.pbe-nsp-van.info
Co.pz-nd-rrkjus.UPF Kr.pw91-n-van.UPF Pb.pz-d-van.UPF Y.pbe-nsp-van.UPF
Co.rel-pz-n-rrkjus.UPF La.pbe-nsp-van.info Pd.pbe-nd-rrkjus.UPF Y.pw91-nsp-van.info
C.pbe-rrkjus.info La.pbe-nsp-van.UPF Pd.pbe-rrkjus.info Y.pw91-nsp-van.UPF
C.pbe-rrkjus-test-diamond.pdf La.pw91-nsp-van.info Pd.pbe-rrkjus.UPF Zn.blyp-van_ak.info
C.pbe-rrkjus-test-graphite.pdf La.pw91-nsp-van.UPF Pd.pz-nd-rrkjus.UPF Zn.blyp-van_ak.UPF
C.pbe-rrkjus.UPF Li.blyp-s-mt.UPF Pd.pz-rrkjus.UPF Zn.bp-van_ak.info
C.pbe-van_ak.info Li.blyp-s-van_ak.info P.pbe-n-van.info Zn.bp-van_ak.UPF
C.pbe-van_ak.UPF Li.blyp-s-van_ak.UPF P.pbe-n-van.UPF Zn.pbe-van.info
C.pbe-van_bm.info Li.bp-s-mt.UPF P.pbe-van_ak.info Zn.pbe-van.UPF
C.pbe-van_bm.UPF Li.bp-s-van_ak.info P.pbe-van_ak.UPF Zn.pw91-n-van.info
C.pw91-van_ak.info Li.bp-s-van_ak.UPF P.pw91-n-van.info Zn.pw91-n-van.UPF
C.pw91-van_ak.UPF Li.pbe-n-van.info P.pw91-n-van.UPF Zn.pw91-van_ak.info
C.pz-rrkjus.info Li.pbe-n-van.UPF P.pw91-van_ak.info Zn.pw91-van_ak.UPF
C.pz-rrkjus.UPF Li.pbe-s-mt.UPF P.pw91-van_ak.UPF Zn.pz-van_ak.info
C.pz-van_ak.info Li.pbe-s-van_ak.info P.pz-bhs.info Zn.pz-van_ak.UPF
C.pz-van_ak.UPF Li.pbe-s-van_ak.UPF P.pz-bhs.UPF Zr.pbe-nsp-van.info
C.pz-vbc.info Li.pw91-n-van.info P.pz-van_ak.info Zr.pbe-nsp-van.UPF
C.pz-vbc.UPF Li.pw91-n-van.UPF P.pz-van_ak.UPF Zr.pw91-nsp-van.info
C.rel-pz-rrkjus.UPF Li.pw91-s-mt.UPF Pt.pbe-nd-rrkjus.UPF Zr.pw91-nsp-van.UPF
Cr.pbe-sp-van.info Li.pw91-s-van_ak.info Pt.pbe-n-van.info Zr.pw91-sp-rrkjus.info
Cr.pbe-sp-van.UPF Li.pw91-s-van_ak.UPF Pt.pbe-n-van.UPF Zr.pw91-sp-rrkjus.UPF
[devsharma at headnode pseudo]$ vi Y.pbe-nsp-van.UPF
[devsharma at headnode pseudo]$ cd
[devsharma at headnode ~]$ cd work/yvo/
[devsharma at headnode yvo]$ ls
CRASH scf.out submit.sh temp yvo.inp
[devsharma at headnode yvo]$
On Mon, Aug 24, 2009 at 2:24 PM, Paolo Giannozzi <giannozz at democritos.it> wrote:
dev sharma wrote:
> Yes, /Y.pbe-nsp-van.UPF is present there in /home/devsharma/pseudo/.
if the code says it isn't there, it isn't there. Remember that
ALL processes must be able to access that file DURING PARALLEL
EXECUTION
P.
--
Paolo Giannozzi, Democritos and University of Udine, Italy
_______________________________________________
Pw_forum mailing list
Pw_forum at pwscf.org
http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum
------------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________
Pw_forum mailing list
Pw_forum at pwscf.org
http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/attachments/20090824/e1a87ffa/attachment-0001.htm
More information about the Pw_forum
mailing list